Vikingeskibsmuseet i Roskilde har, udover de aktiviteter der knytter sig tæt til udstillingen af de 5 vikingeskibsvrag der er udstillet i Vikingeskibshallen, gennem årene udviklet en forskningsorienteret aktivitet. Teori og praksis supplerer hinanden til afdækning af skibsbygge- og sejle måder i vikingeskibstiden. Med oprindelige værktøjer bygges nøjagtige kopier af skibsfund, som så anvendes til afprøvning af sejle egenskaber.
For at kunne formidle disse spændende aktiviteter til offentligheden, blev der i 1997 opført en særlig afdeling af Vikingeskibsmuseet; et arbejdende museum kaldet Museumsøen.. Her er værksteder og bådeværft hvor alle til bådebyggeriet hørende håndværk udforskes. Udover byggeriet af vikingeskibskopierne rebes der tovværk, koges beg, laves sejl og smedes nagler, og i et laboratorium opmåles og imprægneres nye skibsfund. Udover selve Museumsøen, der omfatter 7 bygninger og 3 bådenauster, indeholder projektet en havn, en kanal, boldværker, bådebroer og 3 adgandsbroer.